产品及特点
莱氏无胆甾原体属于柔膜体纲,支原体目,无胆甾原体科,无胆甾原体属。
莱氏无胆甾原体最初分离自污水、肥料、腐土质、土壤和植物组织,后来人们发现在牛生殖道和鼻腔、猪鼻腔、人口腔、鸡窦等各种哺乳动物和鸟类中均发现其寄生现象。莱氏无胆甾原体也是常见的污染细胞的支原体之一。荧光定量 PCR是检测传染性疾病的主流技术,本产品就是以荧光定量 PCR技术为基础开发的专门检测莱氏无胆甾原体的试剂盒,它具有下列特点:
1、即开即用,用户只需要提供样品 DNA模板。
2、引物经过优化,灵敏性高。
3、提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4、特异性高,引物是根据莱氏无胆甾原体高度保守区设计,不会跟其他病原DNA发生交叉反应。
5、本产品足够 50次 20μL体系的探针法荧光定量 PCR反应。
6、本产品只能用于科研。
规格及成分
成分 | 编号 | 十孔盒包装 |
2×qPCR Magic Mix | 90408 | 500 μL(本色盖) |
荧光 PCR专用模板稀释液 | 180701 | 1 mL(黄盖) |
莱氏无胆甾原体染料法 qPCR引物混合物 | 14-75400yw | 100 μL(白盖) |
莱氏无胆甾原体染料法 qPCR阳性对照(1×108拷贝/μL) | 60908-75400pc | 50 μL(黄盖) |
使用手册 | 14-75400sc | 1份 |
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为 12个月。
自备试剂
样品 DNA。10×ROX(根据机型决定,具体见使用方法)。
使用方法
一、稀释标准曲线样品(以 102-107拷贝/μL这 6个 10倍稀释度为例)。
1、注意:由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的 DNA片段作为阳性对照。
2、标记 6个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
3、用带芯枪头分别加入 45 μL荧光 PCR专用模板稀释液,**用带芯枪头,下同)。
4、在 7号管中加入 5 μL 1×108拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1分钟,得 1×107拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5、换枪头,在 6号管中加入 5 μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1分钟,得 1×106拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6、换枪头,在 5号管中加入 5 μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1分钟,得 1×105拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
7、重复上面的操作直到得到 6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品 DNA的制备
8、如果有 N个样品,**设置 N+2个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL阳性对照的 10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为 PC。另外用水作为 NC。
9、用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数 DNA提取试剂盒兼容。
三、设置 qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
10、如果做定量分析并且只做 1次重复,则标记 N+9个 PCR管,其中 N+2个用于上步得到的 N+2个样品,1个用于 PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1次重复,则标记 N+4个 PCR管,其中 N+2个用于上步得到的 N+2个样品,1个用于 PCR阴性对照(用水做模板),1个用于 PCR阳性对照(用第 4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
11、在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
成分 | 样品管N+2个 | PCR阴性对照管 | 标准曲线样品管(2-7管) |
2×qPCR MagicMix(棕色管) | 10 μL | 10 μL | 各 10 μL |
莱氏无胆甾原体 PCR引物混合物(白盖) | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
自备自备 10×ROX (见注) | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
N+2个待测 DNA模板 | 6 μL | 不加 | 不加 |
第 7步所得 PCR阳性对照稀释液(2-7号) | 不加 | 不加 | 各 6 μL(2号样到2号管,3号样到3号管…) |
注:仅 ABI7500、7700和 7900仪器需要使用 ROX作为对照,其他荧光 PCR仪器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene3000、RotorGene 6000和 LightCycler480)不需要使用 ROX,则用水替代。
12、盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR:
过程 | 温度 | 时间 |
预变性 | 95℃ | 5 min |
PCR反应(30个循环) | 94℃ | 60sec |
PCR反应(30个循环) | 55℃ | 60sec |
PCR反应(30个循环) | 72℃ | 60sec |
13、具体操作按所用仪器推荐的流程进行。本产品中所含的荧光染料在不结合 DNA时,最大吸收光谱在 471 nm,结合 DNA时的最大吸收光谱在 500 nm,最大发射光谱在 530 nm。信号采集可以设置在复性或延伸步骤。
四、数据处理
14、如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log值为横轴,以 Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct值从标准曲线上推算出样品 RNA浓度的 log值,再推算出其浓度。
15、如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct必须大于或等于 40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct大于或等于 40则为阴性,如果小于或等于 35则为阳性。如果在 35-40之间,则重复一次。若重复结果 Ct值小于 40,扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性,否则为阴性。